La reserva comunal permite la conservación del curso medio de las quebradas de discurren hacia los ríos Tambo y Ene, que unidas al área que protege el Parque Nacional Otishi, se tiene las cabeceras intactas y microcuencas casi completas. Estas microcuencas comprenden regímenes ecológicos -con disturbios naturales, agentes polinizadores, dispersores de semillas- en una matriz lo suficientemente grande como para proteger poblaciones adecuadas de especies poco comunes. La diversidad de hábitats es extraordinaria.
La reserva comunal unida al Parque Nacional Otishi protege todo el rango de comunidades biológicas de las partes altas de la cordillera de Vilcabamba, desde los bosques enanos y los pajonales en las crestas de las montañas, hasta los bosques montanos y premontanos. Las laderas altas y los bosques de las crestas ameritan una atención especial. Estos hábitats aislados son críticos para la diversidad de animales montanos y para proteger la dinámica de procesos naturales como los deslizamientos y frecuentes derrumbes. De interés especial para la fauna son los hábitats vulnerables de altura, en particular, para la herpetofauna, los arroyos de altura que constituyen buenos hábitats para varias especies.
El área de la Reserva Comunal Asháninka constituye el flanco occidental de la Cordillera de Vilcabamba y presenta un importante vacío de información sobre diversidad biológica en la región, siendo una zona muy poco estudiada y donde se han realizado muy limitadas colectas de flora y fauna o inventarios biológicos. Los descubrimientos de especies nuevas para la ciencia muestran la importancia y la prioridad de realizar investigaciones en esta región (10).
De acuerdo a los estudios del RAP (Rapid Assessment Program / Programa de Evaluación Biológica Rápida) ejecutados por Conservación Internacional, la mayor parte de la reserva está cubierta por vegetación alta de neblina, en laderas de pendiente moderadamente alta. En los estudios se observa poca superposición de especies en las diferentes zonas, lo que es un indicador de alta biodiversidad (11). Hay cuatro zonas de vida en la reserva Bosque Seco Tropical; Bosque Muy Húmedo - Premontano Tropical / Subtropical; Bosque Pluvial - Premontano Tropical / Subtropical; Bosque Pluvial Montano Bajo Tropical y Bosque Pluvial Montano Bajo Subtropical (12).
Flora
De acuerdo al criterio fisonómico, se han distinguido los siguientes tipos de vegetación:
* Bosque alto: Este bosque presenta estratos bien diferenciados, sobresaliendo aquellos ejemplares emergentes de copas anchas, apareciendo entre ellos copas de árboles codominantes. Está ultima característica ocasiona una superficie de apariencia rugosa. Este aspecto es típico de bosques de buen vigor.
* Bosque con paca: Presencia de paca (Guadua sp.) y árboles de poca alzada, lo que es propio de los sitios de vigor pobre.
* Bosque seco: Ubicado en las inmediaciones de la unión de los ríos Ene y Perené.
* Pajonal: Generalmente se encuentra en las partes altas de las montañas.
* Vegetación de áreas con intervención agrícola: Se presentan ciertas áreas con intervención agrícola, debido a que se combinan diferentes tipos de vegetación como agricultura pastos cultivados, bosques secundarios en diferentes etapas de crecimiento y bosques primarios intervenidos, todos ellos formando un mosaico difícil de desagregar.
* Áreas sin vegetación: Son afloramientos rocosos y áreas erosionadas (13).
De acuerdo al análisis estructural de los tipos de bosque existentes en la reserva comunal se observa que las especies presentes en la mayoría de los tipos de bosque son: Chimicua (Pseudolmedia laevigata), moena (Nectandra sp.), shimbillo (Inga ruiziana), quinilla (Pouteria sp.), requia (Guarea sp.), zapotillo (Quaribea bicolo), cumala (Virola peruviana). Les siguen en importancia, carahuasca (Guatteria sp.), mashonaste (Clarisia racemosa), caimitillo (Pouteria sp.), ubos (Spondias monbin), pashaco (Macrolobim sp.), uchumullaca (Trichilia sp.), renaco (Ficus sp.), hualaja (Zanthoxylum risianum), espintana (Osandra sp.), manchinga (Brosimun allicastrum), pumaquiro (Aspidosperma macrocarpon) (14).
Fauna
El área que corresponde a la Reserva Comunal Asháninka dispone de una fauna representativa de los ecosistemas de colinas y montañas bajas en la Amazonía peruana. Mucha de esta fauna sustenta la caza de las comunidades nativas.
De acuerdo con las investigaciones realizadas tanto por el Dr. Terborgh como por el equipo del Field Museum de Chicago y el equipo RAP de Conservación Internacional en 1997 en la Reserva Comunal Asháninka, se estima la presencia de 115 especies de aves. La herpetofauna muestreada estuvo compuesta por 13 especies. Se encontró una densidad relativamente baja de macroinvertebrados acuáticos: 96 individuos/m². En lo que respecta a mariposas se recolectaron 19 especies. Se colectó un total de 60 especies de arañas distribuidas en 16 familias y 22 especies de grillos de cuatro familias. El equipo de trabajo también registró 166 especies de escarabajos de 21 familias. Asimismo, se encontró un total de 102 especies de abejas y avispas sin incluir hormigas, pertenecientes a diez familias (15).
De acuerdo al RAP de Conservación Internacional en 1997, en la Reserva Comunal Asháninka se estima 115 especies de aves pertenecientes a 28 familias. La familia más representada fue Emberezidae con 27 especies (23.9% del total), seguido de Tyrannidae con 17 especies (15.0%), Formicaridae con 12 especies (10.6%) y Thochilidae con 9 especies (8.0%). Varias especies tales como Otus alboguralis y Basileuterus luteoviridis se encuentran típicamente en elevaciones mucho mayores en otras partes del Perú. La expedición encontró Grallaria erytholeuca con relativa frecuencia. Esta especie tiene una distribución muy restringida, y sólo se la conoce en las cadenas montañosas de Vilcabamba y Vilcanota. Aunque no se han hecho comparaciones detalladas, la población de la Cordillera de Vilcabamba podría representar un taxón aún no descrito.
Los densos matorrales de bambú están ocupados por ratas de bambú (Dactylomys peruanus), este lugar bien podría ser una nueva extensión de la distribución de esta especie que ha sido colectada en raras ocasiones. El estudio registró por lo menos tres especies de primates, incluyendo monos araña, monos nocturnos y capuchinos. Como los primates han sido reducidos severamente por la caza en tierras bajas, las partes altas de la reserva comunal son un refugio local importante.
La herpetofauna muestreada estuvo compuesta por 13 especies. La fauna de las ranas en el sitio fue básicamente similar a la que se encontró en elevaciones similares dentro del Parque Nacional del Manú, pero fue inusual no haber encontrado especimenes de Hyla o Phrynops, que normalmente están presentes a altitudes similares. Es posible que la ausencia de Hyla se deba a la falta de hábitat adecuado. Hasta dos terceras partes de las especies de ranas encontradas pueden ser nuevas para la ciencia (16).